外部の受注管理システムにて受注処理を行っておりますが、「受け取り通知メール」をシステムより配信することはできますか？

受注管理システムへ対応可否をご確認くださいませ。

店舗受取の情報をシステムへ連携するには、
任意受注連絡メールおよびfutureshop形式の受注データにて「店舗受取情報」を追加することで可能ですので、
店舗受取用のデータを取り込めるように調整をお願いいたします。

設定＞メール＞メール設定一覧　任意受注連絡メールの設定変更
運用＞受注管理＞受注データ取得項目設定　「futureshop」タブ

■マニュアル
任意受注連絡メール設定：https://www.future-shop.jp/manual/settings/emailCustomOrder.html
futureshop形式：https://www.future-shop.jp/manual/orderdata/futureshopCSV.html